而长在卵巢上的子宫内膜，也会跟著生理周期每个月排血，但这些经血无法正常排出体外，被包覆在卵巢上面，日积月累就会形成像巧克力一般又黑又稠的瘤，因此暱称为“巧克力囊肿”。统计发现，平均每3名不孕妇女就有1人是因巧克力囊肿，或子宫内膜异位症，而无法顺利怀孕。

　　许多人认为经血逆流是造成子宫内膜异位症和巧克力囊肿的主要原因，不过，专家表示，90％女性都有经血倒流的情形，但临床发生子宫内膜异位症比率却不到20％，更根本的原因还是在免疫系统出了问题。免疫系统失常，无法将逆流经血中的内膜细胞排除或移除，内膜细胞就会在子宫以外的部位生存下来，若落脚于卵巢，则成为巧克力囊肿。

　　诊断上，除了妇科超音波检查和抽血验CA-125有助诊断巧克力囊肿之外，更精确的方法还是要做腹腔镜检查。专家表示，治疗子宫内膜异位症和巧克力囊肿的最好方法就是“让月经停下来”，月经停止，不再反覆性出血，子宫内膜异位症就会停在原地，有助身体免疫系统启动以清除这些子宫内膜异位细胞。而女性不让月经来的方法，一是停经，另一则是怀孕。

　　对育龄女性来说，若子宫内膜异位症的情况轻微，代表子宫内膜异位症并未真正造成巧克力囊肿，通常赶快怀孕就能改善。若是巧克力囊肿超过2公分的中度子宫内膜异位症患者，则需手术分离沾黏部位，才能帮助怀孕。重度患者的巧克力囊肿沾黏情况更严重，甚至已侵犯到膀胱、大肠直肠，治疗相当棘手，除了手术，还需搭配药物治疗，以争取怀孕的时间。

　　除了怀孕和更年期之外，部分新时代女性抱持着不婚不孕的态度，想要摆脱子宫内膜异位症或巧克力囊肿的纠缠，也不是没有办法，医师建议要更关心自己，不要有太多额外的压力，早睡早起，均衡饮食，把免疫系统顾好，自然也能预防疾病发生，或避免恶化。